>すべてのメールをチェックした後、削除してゴミ箱も空にしたのですが

メーラーのメールを削除しただけで、サーバーのメールを削除できていないではないでしょうか？

以下を参考にしてサーバーの状態をみてください。

サーバーについてのあれこれ

上記からのリンクもありますが、再掲しておきます。
メール設定チェック（サーバーの受信テスト）

サーバーがいっぱいではなかった場合、ヤフオクのアラートが四六時中メール送信しているものなのか、よく知りませんので、ヤフオクの設定を変更してみてください。また、受信できないと思う時間にテストメールを送信（自分から自分へ）してみて、サーバーの問題ではないかもしれないとかの検証をしてみてください。

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