回答ありがとうございます。
ticoさんに提案していただいた方法を試してみました。

retrコマンドでは、やはり2バイト文字の表示ができませんでしたが、メールヘッダが見れたので、それを参考にメールの削除を行っていきました。
それでも、なかなかnPOPでの取得ができなかったため、結局全部のメールを消すことにしました。
重要なメールが届くアドレスでもなかったもので。

> nPOPで受信の一覧が出来なかった時、私はBeckyでサーバーから削除しましたが、Beckyは有料です。でもメールソフトとしては優良です。（笑）

Beckyにもそういう機能がついてたんですね。
でもしかし、有料という部分をやはり憂慮してしまいます（苦笑）

私の場合、nPOPの持ち運びができる手軽さが気に入ってるので、それならフリーメールの有料オプションの方を選ぶかもしれません。
そういえば、今回も105円出して、一月分だけ申し込んでしまえばよかったんだなぁと今更気が付きましたが後の祭り・・・

トラブルの本当の原因が分からないままに、半ば解決を諦めた対応をとってしまったため、他の人の参考になる情報を残せないのが心苦しいですが、とりあえず私のところでの問題はなくなりましたのでご報告いたします。
原因となるメールを探し出す方法でも発見できれば、後々いろんな人の役に立ったのですが。短気で申し訳ないです。

最後になりますが、ticoさん、どうもありがとうございました。

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