とりあえず（←口癖（笑））解決したようで好かったですね。
通常のメーラーは、利用者が設定を変えない限り、ふつうは、サーバーからメールを受信するときに”サーバーにメールを残さない”ようにしていると思うんです。ですから、メーラーに受信したら（パソコンに保存されたら）メールボックスにはメールは残らないはずなんです。それはOutlookでもThunderbirdでも同じだと思います。表現はいろいろですが「サーバーにメールを残す」というような意味の設定がどうなっているかチェックしてみてください。「残さない」設定になっていれば、メールがPOPサーバー（メールボックス）にいっぱいになっていないかぎり、新規のメールは受信できますし、メーラーを使って受信をしたらメールはボックスには残りません。
もしボックスにいっぱいなら、それ以降のメールは受信できず、送信者にはデーモンくんからの返信が行くはずです。もし、まるさんが送信者に心当たりがあるのでしたら、再送をお願いしてはいかがでしょうか？

繰り返しますが、ふつうにメーラーで受信していればnPOPの出番はありません。「サーバーに残さない」設定にしておくことです。

これでおわかりでしょうか？

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